プロトコル

方法の項を書く

よい方法の項があれば、ほかの人があなたの実験を再現できます。ここに出発点があります。

査読者や読者は、試験が正確にどう行われたかを知りたがっています。以下の例文は、どんな詳細を入れるべきかを示しています。出発点として扱ってください。すべての値を実際に行ったことに合わせて変え、自分のプール、部屋、動物の詳細を加えます。

モリス水迷路(動画トラッキング)

HVS Imageでトラッキングした水迷路のための、すぐに手直しして使える方法の段落です。各[角かっこ]を自分の値に置き換えます。

遊泳経路はトラッキング用カメラで記録し、HVS Image動画トラッキングソフトウェア([バージョンとビルド])で解析した。プール([プール直径] cm)は水面のNorth、South、West、Eastの縁をクリックしてキャリブレーションし、使用したすべてのプラットフォームの位置をキャリブレーションして、プールの中央を位置0とした。プラットフォームの直径は[目標直径] cmであった。1日[試行数]回の試行を[日数]日間、[出発点]から行い、最大時間は[Max Seconds] sとした。試行は[プラットフォーム到着時 / 被験体がプラットフォームに[n] sとどまった後 / 手動で]終了した。プローブ試行([プローブ時間] s)では学習したプラットフォームの位置を入力し、指標が学習した位置を基準に計算されるようにした。潜時、経路長、平均遊泳速度と活動遊泳速度、標的象限の時間%、プラットフォーム通過、近接遭遇、壁沿い行動、ギャラガー近接度はHVS Imageで計算し、壁沿い帯はプール半径の[帯の値]、近接遭遇カウンターは[カウンターの値]、不活動のしきい値は[しきい値] m/sとした。[遠位の手がかりの配置。][水深、水温、不透明度:プロトコルから。]手順はMorris (1984)に、近接度の指標はGallagher et al. (1993)に基づいた。

著者向けのメモ

すべての[角かっこ]を、自分のプロトコルと保存したファイルから埋めます。カウンターの大きさなどの解析設定は‘Advanced’で選び、ビルドはHVS Imageのメインメニューの右側に表示されます。使ったビルドと解析設定を報告し、1つの研究の中では一定に保ちます。プラットフォーム通過、近接遭遇、ギャラガー近接度、Direct Path Measuresなどのプローブの指標は、学習した位置を基準に解釈します。

Vorhees and Williams (2006)は、参照記憶はプラットフォームがないときのプラットフォーム領域への選好で決まると述べ、手がかり試行によって場所学習と無関係な遂行要因があるかどうかがわかると指摘しています。実施した手がかり試行があれば、記述することを検討してください。

バーンズ迷路(動画トラッキング)

HVS Imageでトラッキングしたバーンズ迷路のための、すぐに手直しして使える方法の段落です。

行動はトラッキング用カメラで記録し、HVS Image動画トラッキングソフトウェア([バージョンとビルド])のバーンズ迷路で解析した。迷路の面([迷路直径] cm、穴[穴の数]個)は面の上、下、左、右の端をクリックしてキャリブレーションし、各穴の位置をキャリブレーションした。試行は最大[Max Seconds] sとし、被験体が逃避穴に入った時点で[手動で / ‘Auto-end on escape hole’により自動で]終了した。穴への接近は自動で数え、穴ごとののぞき込み(エラー)、標的の穴までの潜時と経路長、一次経路長を計算し、壁沿い帯は[帯の値](穴が帯の中に入るよう設定)、カウンターの大きさは[カウンターの値]とした。プローブ試行([プローブ時間] s)では学習した標的の穴を目標として入力した。[逃避箱、嫌悪刺激、照明:プロトコルから。]

著者向けのメモ

すべての[角かっこ]を、自分のプロトコルと保存したファイルから埋めます。カウンターの大きさなどの解析設定は‘Advanced’で選び、ビルドはHVS Imageのメインメニューの右側に表示されます。使ったビルドと解析設定を報告し、1つの研究の中では一定に保ちます。試行を手動で終えたか、‘Auto-end on escape hole’で自動で終えたかを明記します。

Barnes (1979)は、解決に空間的な手がかりを使うよう促す円形のプラットフォームでラットを試験しました。課題の起源を述べるなら引用してください。

オープンフィールドと新奇物体認識(動画トラッキング)

HVS Imageでトラッキングしたオープンフィールドや物体の試験のための、すぐに手直しして使える方法の段落です。

行動はトラッキング用カメラで記録し、HVS Image動画トラッキングソフトウェア([バージョンとビルド])で解析した。トラッキング領域([高さ] × [幅] cm、アリーナ[アリーナ数]個)は左上と右下の角をクリックしてキャリブレーションした。解析ではトラッキング領域を[グリッドの大きさ]のグリッドに分け、各ゾーンの時間%、経路%、進入、潜時を、総経路長、平均速度、[タイムビンを使った場合:[ビン数]]とともに計算した。すくみは[時間] sの間に[距離] cm以下しか動かないことと定義した。[物体の試験の場合:物体はゾーンの中央に置き、各物体の近くにいた時間は体の中心のトラッキングから採点し、においかぎと接触は[方法]で手動採点した。]試行は[Max secs] sとした。[アリーナの材質、照明、被験体間の清掃:プロトコルから。]

著者向けのメモ

すべての[角かっこ]を、自分のプロトコルと保存したファイルから埋めます。カウンターの大きさなどの解析設定は‘Advanced’で選び、ビルドはHVS Imageのメインメニューの右側に表示されます。使ったビルドと解析設定を報告し、1つの研究の中では一定に保ちます。すくみと不活動の基準は利用者が設定するので、距離と時間窓の両方を明記します。

オープンフィールドの不安関連の指標:Simon et al. (1994)は最初の数分間の壁沿い行動の程度をマウスの不安の指標とみなし、Prut and Belzung (2003)はオープンフィールドを不安様行動の非常に人気のある動物モデルとしてレビューしています。物体認識については、従った1試行の物体認識法を引用してください。

多肢迷路と高架式十字迷路(動画トラッキング)

HVS ImageでトラッキングしたT字・Y字・十字・放射状迷路のための、すぐに手直しして使える方法の段落です。

行動はトラッキング用カメラで記録し、HVS Image動画トラッキングソフトウェア([バージョンとビルド])で解析した。[迷路のタイプ]([アームの寸法])は、ソフトウェアが示す順に迷路の点をクリックしてキャリブレーションした。アームへの進入は、各アームの[割合]%のDetection Areaで定義した(100%ではどの進入も数える)。総アーム進入、訪れたアーム、アームごとの進入、潜時、アームごとの経路%と時間%、アーム進入の順序を計算した[;高架式十字迷路では、オープンアームとクローズドアームの時間%と進入を計算した(Walf and Frye, 2007)]。試行は[Max secs] sとした。[迷路の高さ、壁の材質、照明、清掃:プロトコルから。]

著者向けのメモ

すべての[角かっこ]を、自分のプロトコルと保存したファイルから埋めます。カウンターの大きさなどの解析設定は‘Advanced’で選び、ビルドはHVS Imageのメインメニューの右側に表示されます。使ったビルドと解析設定を報告し、1つの研究の中では一定に保ちます。いつでも別のDetection Areaの割合で解析し直せるので、各解析で使った値を明記します。

そのほかの出典:Pellow et al. (1985)はオープン : クローズドのアーム進入をラットの不安の指標として検証し、Olton and Samuelson (1976)は8方向放射状迷路でラットを試験し、Deacon and Rawlins (2006)はT字迷路の交替のプロトコルを示しています。

強制水泳試験(動画トラッキング)

HVS Imageでトラッキングした強制水泳試験のための、すぐに手直しして使える方法の段落です。

行動はトラッキング用カメラで記録し、HVS Image動画トラッキングソフトウェア([バージョンとビルド])で解析した。容器[容器数]個をトラッキングし、トラッキング領域は水面線の周りの帯([帯の高さ] × [帯の幅] cm)としてキャリブレーションし、被験体のいちばん高い点が、よじ登るときは上の3分の1、泳いだり浮いたりするときは真ん中の3分の1、潜るときは下の3分の1に来るように大きさを決めた。HVS Imageは、トラッキング領域内の被験体のいちばん高い部分から、よじ登り、遊泳/浮遊、潜水を分類し、遊泳と浮遊は速度で区別した。よじ登り、遊泳、浮遊、潜水の時間%、総経路長、平均速度を計算した。試行は[Max secs] sとした。[容器の寸法、水深と水温、事前試験のセッション:プロトコルから。]

著者向けのメモ

すべての[角かっこ]を、自分のプロトコルと保存したファイルから埋めます。カウンターの大きさなどの解析設定は‘Advanced’で選び、ビルドはHVS Imageのメインメニューの右側に表示されます。使ったビルドと解析設定を報告し、1つの研究の中では一定に保ちます。分類は動物のいちばん高い点が帯のどこに来るかで決まるので、帯を丁寧に記述します。

検証済みの出版物データベースにはまだ強制水泳の論文がないので(古典的な文献が1つ提案され、承認待ちです)、手順についての自分の一次文献を加えてください。

VR水迷路(HVS 6D VR)

HVS 6D VRで実施し、HVS Imageで解析したヒトのVR水迷路のための、そのまま編集できる方法の段落です。

課題は、Linkケーブルで接続したQuest 3ヘッドセットを用いてHVS 6D VR([version])で実施し、参加者は[Omnidriveトレッドミル/トレッドプレート/矢印キー/頭の傾き]で移動した。各実験はvrScriptファイル(HVS Image vrScript technical reference, doi:10.5281/zenodo.22303968)で定義し、トラッキング直径は[TRACKING_DIAMETER]、目標半径は[TARGET_RADIUS] m、最大試行時間は[MAXIMUM_TIME]、そして[手がかりの配置とシーン]とした。スタート位置と向きはvrScriptで試行ごとに定義した。HVS 6D VRはタイムスタンプ付きの位置を記録し、HVS Image([version and build])はすべての指標について、それを100 msごとに1位置(10 Hz)に平滑化した。試行はHVS Imageで水迷路と同様に解析し、不活動の閾値は[threshold] m/sとした(HVS Image Inactivity technical note, doi:10.5281/zenodo.21797205)。[プロトコルに基づく参加者の募集、同意、安全手順、練習。]

著者向けのメモ

すべての[角かっこ]は、最良の設定記録であるvrScriptファイルと.BONDヘッダーから埋めてください。げっ歯類の迷路と比較できるよう、TRACKING_DIAMETERは200を推奨します。げっ歯類とヒトのVRの値を直接比べてはいけません。HVS 6D VRは実験者の手助けを記録しないので(スクリプト化した音声は可能)、手助けをした場合は説明してください。

Astur et al.(1998)は、モリス水課題のコンピューター版を使い、それがヒトの領域に一般化できるかを評価しました。ヒトの仮想水迷路の先例を論じる場合は、この論文を引用してください。

不活動(浮遊)の指標

HVS Imageの不活動や活動速度を報告するときに加える一文です。

不活動は[しきい値] m/s未満の速度と定義した。位置は[最大60 Hzでサンプリング(動画トラッキング)/ 可変レートで記録(HVS 6D VR)]し、100 msごとに1つの位置に平滑化した。区間ごとの速度は、連続する平滑化位置間のユークリッド距離を経過時間で割った値とし、しきい値未満の区間を不活動に分類し、不活動%は不活動時間の合計を試行全体の時間で割った値とした(HVS Image Inactivity technical note, doi:10.5281/zenodo.21797205)。

著者向けのメモ

既定のしきい値は0.05 m/s(5 cm/s)で、種、プロトコル、仮想環境に合わせて変えられるので、使った値を明記します。

活動速度は不活動のしきい値以上の区間だけを使います(既定値ではちょうど0.05は活動として数えます)。潜時と経路長を解釈するときは、不活動と並べて報告します。

Direct Path Measures

HVS ImageのDirect Path Measuresを報告するときに加える一文です。

初期の接近はHVS Image Direct Path Measures(HVS Image Direct Path Measures technical note, doi:10.5281/zenodo.21870806; HVS Image [バージョンとビルド])で分類し、近接遭遇カウンターは[Counter diam x value]、プールサイドゾーン(ThigRatio)は[値]、進行距離は[Heading rangeとして書き出された値]とした。実際の経路 / 最短経路が1.2以下なら直接と分類し、分類は最初の到着のみを考慮し、試行が目的地の外から始まった場合にのみ評価した。

著者向けのメモ

この3つの設定は1つの研究の中で一定に保ち、報告します。値を思い込まず、書き出したHeading rangeを確認します。解析し直したデータにはビルドを報告します。

自動ルールは最近のもので、まだ査読を経た検証論文がないので、技術ノートで定義されているとおりに記述します。タイムスライスにはDirect Pathの分類は作られません。

ギャラガー近接度、生の値と補正値

HVS Imageのギャラガー近接度を報告するときに加える一文です。

探索の近接度は、ギャラガーの全体近接度([試行 / タイムスライス]を通じた目標からの平均距離)と累積近接度(1秒ごとの平均距離の合計)として定量化し(Gallagher et al., 1993)、HVS Image([バージョンとビルド])で計算した。補正値では、被験体の平均活動遊泳速度で出発点から目標までの直線距離を泳ぐのに要する時間を除外し、生の値と補正値を併せて報告する。

著者向けのメモ

逃避時間が合計の区間を決めるので、累積近接度は潜時や経路長と合わせて読みます。有効な目標がない、経路データが少なすぎる、活動速度がない、補正後にサンプルが残らない場合、補正値は'該当なし'になります。

Gallagher et al. (1993)は、この近接度の指標が加齢に伴う障害に非常に敏感であることを見いだしました。補正後に残る記録がごく短い場合、値が出ても解釈が限られることがあります。

HVS Imageを使った場合は、HVS Imageの解析と手法の引用をご覧ください。

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