实验方案
撰写方法部分
好的方法部分能让别人照着做你的实验。这里给你一个起点。
审稿人和读者想确切知道测试是如何进行的。这些示例段落展示了应包含的细节类型。把它们当作起点:按你实际所做的修改每一个数值,并补充你自己的水池、房间和动物细节。
莫里斯水迷宫(视频追踪)
一段可直接修改使用的方法段落,适用于用HVS Image追踪的水迷宫。把每个[方括号]替换为你自己的数值。
游泳路径用追踪摄像头记录,并用HVS Image视频追踪软件([版本和版本号])分析。通过点击水面的North、South、West和East边缘校准水池([水池直径] cm),并校准了所用的每个平台位置,以水池中心为位置0;平台直径为[目标直径] cm。每天进行[试次数]个试次,共[天数]天,起点为[起点],最长时间为[Max Seconds] s;试次在[到达平台时 / 受试对象在平台上停留[n] s后 / 手动]结束。在探测试验([探测时长] s)中输入已学平台位置,使各指标相对于已学位置计算。潜伏期、路径长度、平均和活动游泳速度、目标象限时间百分比、平台穿越、近距离接触、趋触性和Gallagher接近度均在HVS Image中计算,趋触性带为水池半径的[带值],近距离接触计数器为[计数器值],不活动阈值为[阈值] m/s。[远端线索布置。][水深、水温和不透明度,取自你的方案。]程序依据Morris (1984),接近度指标依据Gallagher et al. (1993)。
作者须知
根据你自己的方案和保存的文件填写每一个[方括号]。计数器大小等分析设置在‘Advanced’中选择,版本号显示在HVS Image主菜单右侧。报告你所用的版本号和分析设置,并在一项研究中保持不变。平台穿越、近距离接触、Gallagher接近度和Direct Path Measures等探测指标都相对于已学位置来解读。
Vorhees and Williams (2006)把参考记忆描述为由平台不在时对平台区域的偏好来确定,并指出线索试次可判断是否存在与位置学习无关的表现因素;如果你做过线索试次,可考虑加以描述。
Barnes迷宫(视频追踪)
一段可直接修改使用的方法段落,适用于用HVS Image追踪的Barnes迷宫。
行为用追踪摄像头记录,并用HVS Image视频追踪软件([版本和版本号])中的Barnes迷宫进行分析。通过点击表面的上、下、左、右端点校准迷宫表面([迷宫直径] cm,[孔数]个孔),并校准了每个孔的位置。试次最长持续[Max Seconds] s,受试对象进入逃避孔时[手动 / 通过‘Auto-end on escape hole’自动]结束。孔接近次数自动计数,并计算了每个孔的探头(错误)次数、到目标孔的潜伏期和路径长度以及主要路径长度,趋触性带为[带值](设置为使各孔落在带内),计数器大小为[计数器值]。在探测试验([探测时长] s)中,以已学的目标孔作为目标输入。[逃避箱、厌恶刺激和照明,取自你的方案。]
作者须知
根据你自己的方案和保存的文件填写每一个[方括号]。计数器大小等分析设置在‘Advanced’中选择,版本号显示在HVS Image主菜单右侧。报告你所用的版本号和分析设置,并在一项研究中保持不变。说明试次是手动结束还是通过‘Auto-end on escape hole’自动结束。
Barnes (1979)在一个有利于利用空间线索解决问题的圆形平台上测试大鼠;如果描述该任务的起源,请引用它。
旷场与新物体识别(视频追踪)
一段可直接修改使用的方法段落,适用于用HVS Image追踪的旷场或物体测试。
行为用追踪摄像头记录,并用HVS Image视频追踪软件([版本和版本号])分析。通过点击追踪区域的左上角和右下角对其([高度] × [宽度] cm;[场地数]个场地)进行校准。分析时把追踪区域划分为[网格大小]网格,计算每个区域的时间百分比、路径百分比、进入次数和潜伏期,以及总路径长度、平均速度和[如使用时间段:[时间段数]]。僵住定义为在[时间] s内移动不超过[距离] cm。[对于物体测试:物体放在区域中心,在每个物体附近的时间根据身体中心追踪评分;嗅探和接触由[方法]人工评分。]试次持续[Max secs] s。[场地材料、照明以及受试对象之间的清洁,取自你的方案。]
作者须知
根据你自己的方案和保存的文件填写每一个[方括号]。计数器大小等分析设置在‘Advanced’中选择,版本号显示在HVS Image主菜单右侧。报告你所用的版本号和分析设置,并在一项研究中保持不变。僵住和不活动的标准由用户设定,所以要同时说明距离和时间窗。
旷场焦虑相关指标:Simon et al. (1994)把最初几分钟内的趋触性程度视为小鼠焦虑的指标,Prut and Belzung (2003)综述了旷场作为一种非常流行的焦虑样行为动物模型。对于物体识别,请引用你所采用的单次试验物体识别方法。
多臂迷宫与高架十字迷宫(视频追踪)
一段可直接修改使用的方法段落,适用于用HVS Image追踪的T迷宫、Y迷宫、十字迷宫和放射臂迷宫。
行为用追踪摄像头记录,并用HVS Image视频追踪软件([版本和版本号])分析。按软件指示的顺序点击迷宫各点,对[迷宫类型]([臂尺寸])进行校准。进臂定义为使用每条臂[百分比]%的Detection Area(100%时任何进入都计数)。计算了总进臂次数、访问过的臂、各臂进入次数、潜伏期、各臂路径百分比和时间百分比以及进臂顺序[;对于高架十字迷宫,计算了开放臂与封闭臂的时间百分比和进入次数(Walf and Frye, 2007)]。试次持续[Max secs] s。[迷宫高度、墙壁材料、照明和清洁,取自你的方案。]
作者须知
根据你自己的方案和保存的文件填写每一个[方括号]。计数器大小等分析设置在‘Advanced’中选择,版本号显示在HVS Image主菜单右侧。报告你所用的版本号和分析设置,并在一项研究中保持不变。你随时可以用其他Detection Area百分比重新分析,所以要说明每次分析所用的百分比。
更多来源:Pellow et al. (1985)验证了开放臂 : 封闭臂进入次数可作为大鼠焦虑的指标;Olton and Samuelson (1976)在八臂迷宫上测试大鼠;Deacon and Rawlins (2006)给出了T迷宫交替方案。
强迫游泳试验(视频追踪)
一段可直接修改使用的方法段落,适用于用HVS Image追踪的强迫游泳试验。
行为用追踪摄像头记录,并用HVS Image视频追踪软件([版本和版本号])分析。追踪了[容器数]个容器;追踪区域校准为水面线周围的带状区域([带高] × [带宽] cm),其大小使受试对象的最高点在攀爬时位于上三分之一,游泳或漂浮时位于中间三分之一,下潜时位于下三分之一。HVS Image根据追踪区域内受试对象的最高部位区分攀爬、游泳/漂浮和下潜,并按速度区分游泳与漂浮。计算了攀爬、游泳、漂浮和下潜的时间百分比、总路径长度和平均速度。试次持续[Max secs] s。[容器尺寸、水深和水温以及预测试环节,取自你的方案。]
作者须知
根据你自己的方案和保存的文件填写每一个[方括号]。计数器大小等分析设置在‘Advanced’中选择,版本号显示在HVS Image主菜单右侧。报告你所用的版本号和分析设置,并在一项研究中保持不变。分类取决于动物最高点落在带内的位置,所以要仔细描述带状区域。
经过核实的出版物数据库中尚无强迫游泳论文(已提议一篇经典文献,正在等待批准),所以请为该程序添加你自己的原始参考文献。
VR水迷宫(HVS 6D VR)
一段可直接编辑的方法描述,适用于在HVS 6D VR中运行、用HVS Image分析的人类VR水迷宫。
任务在HVS 6D VR([version])中运行,使用通过Link线缆连接的Quest 3头显;参与者使用[Omnidrive跑步机 / 踏板 / 方向键 / 头部倾斜]进行导航。每个实验均在vrScript文件中定义(HVS Image vrScript technical reference, doi:10.5281/zenodo.22303968),追踪直径为[TRACKING_DIAMETER],目标半径为[TARGET_RADIUS] m,最长试次时间为[MAXIMUM_TIME],以及[线索布置与场景]。起始位置和朝向在vrScript中按试次定义。HVS 6D VR记录带时间戳的位置,HVS Image([version and build])针对所有指标将其平滑为每100 ms一个位置(10 Hz)。试次在HVS Image中按水迷宫方式分析,不活动阈值为[threshold] m/s(HVS Image Inactivity technical note, doi:10.5281/zenodo.21797205)。[根据你的方案填写参与者招募、知情同意、安全程序和练习。]
作者须知
根据你的vrScript文件和.BOND文件头填写每一个[方括号],它们是最好的配置记录。为与啮齿动物迷宫可比,建议TRACKING_DIAMETER设为200。啮齿动物与人类的VR数值不应直接比较。HVS 6D VR不会记录实验者的协助(可以使用脚本化音频),所以如有协助请加以说明。
Astur等(1998)使用计算机版莫里斯水任务,评估其能否推广到人类领域;如果讨论人类虚拟水迷宫的先例,请引用该文。
不活动(漂浮)指标
报告HVS Image的不活动或活动速度时可添加的句子。
不活动定义为速度低于[阈值] m/s。位置[以最高60 Hz采样(视频追踪)/ 以可变速率记录(HVS 6D VR)],并平滑为每100 ms一个位置;每个时间间隔的速度为相邻平滑位置之间的欧氏距离除以经过时间,低于阈值的间隔归为不活动,不活动百分比为不活动时长之和除以试次总时长(HVS Image Inactivity technical note, doi:10.5281/zenodo.21797205)。
作者须知
默认阈值为0.05 m/s(5 cm/s),可根据物种、方案或虚拟环境更改,所以要说明你所用的数值。
活动速度只使用达到或高于不活动阈值的间隔(在默认值下恰好0.05算作活动),所以在解读潜伏期和路径长度时,要把它与不活动一起报告。
Direct Path Measures
报告HVS Image的Direct Path Measures时可添加的句子。
初始接近使用HVS Image Direct Path Measures进行分类(HVS Image Direct Path Measures technical note, doi:10.5281/zenodo.21870806; HVS Image [版本和版本号]),近距离接触计数器为[Counter diam x value],池边区域(ThigRatio)为[数值],朝向距离为[数值,即导出的Heading range]。实际路径 / 最短路径不超过1.2时归为直接路径;分类只考虑第一次到达,且仅在试次从目的地之外开始时才进行评估。
作者须知
在一项研究中保持这三个设置不变并报告它们;检查导出的Heading range,而不要假设某个数值。对重新分析的数据报告版本号。
这些自动规则较新,尚无经同行评审的验证论文,所以要按技术说明中的定义来描述。时间片段不生成Direct Path分类。
Gallagher接近度:原始值与校正值
报告HVS Image的Gallagher接近度时可添加的句子。
搜索接近度以Gallagher全局接近度([试次 / 时间片段]内到目标的平均距离)和累积接近度(每秒平均距离之和)进行量化(Gallagher et al., 1993),在HVS Image([版本和版本号])中计算。校正值排除了以受试对象平均活动游泳速度游完起点到目标直线距离所需的时间;原始值和校正值一并报告。
作者须知
由于逃脱时间决定了求和的时间窗,累积接近度应与潜伏期和路径长度一起解读。当没有有效目标、路径数据太少、没有活动速度或校正后没有剩余样本时,校正值为'不适用'。
Gallagher et al. (1993)发现该接近度指标对年龄相关的损害高度敏感。校正后剩余记录很短时,即使得出数值,也可能限制解读。
如果你使用了HVS Image,请参见HVS Image分析与方法的引用。