バリエーション · VR

VRのデータと解析

生の試行ファイルから方法の項まで。

仮想の試行は、位置、向き、時間という豊富なデータを生みます。ここでの質問は、データがどこへ保存されるか、何を保管すべきか、どう解析し報告するかを扱います。

VR水迷路の指標

VRの試行は水迷路とまったく同じように‘Morris Water Maze’ > ‘ANALYZE’で解析するので、同じ指標を同じように読みます。Quad1はNE、Quad2はSE、Quad3はSW、Quad4はNWで、ビデオトラッキングの順序と同じです。

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HVS 6D VRは時刻付きの位置を可変のレートで記録し、HVS Imageはそれを100 msごとに1つの位置(10 Hz)へ平滑化して.hvsに保存し、すべての指標に使います。活動速度は、不活動のしきい値(既定0.05 m/s、調整可)以上の区間だけを使います。

For the VR water maze, a diameter of 200 (cm) is recommended so results are comparable with the rodent maze; keep it consistent across experiments. Rodent and human VR inactivity values should not be compared directly. Cite the HVS vrScript technical reference (doi:10.5281/zenodo.22303968) and the inactivity documentation (doi:10.5281/zenodo.21797205).

HVS 6D VR水迷路の結果の読み方

VR試行は水迷路とまったく同じように解析されるので、同じ指標と注意点が当てはまります。げっ歯類とヒトのVRの値を直接比べてはいけません。

典型的な対照群のパターン
VR専用の対照パターンはまだ検証されていないので、結果は水迷路と同じように読んでください。象限の指標は目標が象限の中央にあるときだけ意味を持ち、そうでなければ接近とギャラガー近接度を使ってください。
障害のサイン
ヒトが隠れた逃避プラットフォームへたどり着くために空間的手がかりを使わなければならないとき、海馬切除を受けた患者は、年齢を合わせた対照群に比べて空間ナビゲーションに重い障害を示します(Astur et al., 2002)。
強い記憶のサイン
この試験について確認された公表パターンはまだないため、ご自身の対照群と比べてください。

結果のように見えるセットアップの問題

  • 参加者が止まったあとも動きが続く:SMOOTH_MOTIONを短くしてください。小さな振動や音で参加者が動いてしまう場合は、OMNI_SENSを少し下げてください。
  • 軽い歩みが検出されない:OMNI_SENSを上げてください。
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VR解析では、その試行で使ったプラットフォーム位置だけが表示されます。プローブ試行は目標に到達しても最大時間まで続くので、学習した位置をTARGET_POSITIONに入れておけば、図に表示され、解析されます。HVS 6D VRは実験者の手助けを記録しないので、手助けをした場合はメモしておいてください。

Astur et al.(1998)は、さまざまな指標にわたって、男性が女性より隠れたプラットフォームにうまくたどり着くことを一貫して見いだしました。Thornberry et al.(2021)は、特に環境のセットアップと手順の面で、仮想水迷路の使われ方に一貫性がないと報告しているので、環境と手がかりを漏れなく報告してください。

よくある質問

VR試行のデータはどこに保存され、なぜ新しい試行が見えないのですか?

すべての試行はJSONの.BONDファイルと.hvsファイルとして自動保存されます。アップグレード後は、新しい試行が一覧のいちばん上に出ることがあります。1)BONDの場所はData_File_Location.txtで確認します。2)一覧のいちばん上を見るか、HVSフォルダーを日付順に並べます。3)役立つなら古いファイルをサブフォルダーへ移します(一緒に解析するときは戻します)。

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時刻付きの位置データとすべての設定は、C:\Users\User\AppData\LocalLow\HVS Image Software Ltd\HVS 4D VR\Data_File_Location.txtに書かれた場所のJSON .BONDファイルに保存されます。BONDフォルダーはHVSと同じDataフォルダーの中にあります(例:…\Data\Morris Water Maze\HVS)。アップグレード後はファイル番号が振り直されるので、新しい試行は解析一覧の上のほうに出ます。エクスプローラーで日付順に並べ、古いファイルをサブフォルダーへ移すと便利です。不要なテストファイルは、番号に影響せずに移動や削除ができます。

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Data_File_Location.txtがない場合は、試行を正しいフォルダーへ移せるようHVSにご連絡ください。心拍数とEEGのデータはBONDのサブフォルダーにあります。出力には.hvs/.sum(テキスト、CSV、SPSS、Excel)と.bond(JSON)があります。

関連: どのVRファイルを保管し、バックアップすべきですか?

どのVRファイルを保管し、バックアップすべきですか?

.BONDと.hvsのファイルは両方とも保管してバックアップしてください。これが生データです。1)新しいCSTを作るために.sumファイルを保管します。2)新しい.sumファイルを作るために.hvsファイルを保管します。3)補正した.hvsファイルを作り直せるので.BONDファイルを保管します。4)自動バックアップについてはHVSにお尋ねください。

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.sumファイル(またはそれを作り直すための.hvsファイル)を保管していれば別の変数で新しい結果ファイルを作れ、.hvsファイルを保管していれば別の試行の組み合わせで新しい.sumファイルを作れます。.BONDと.hvsは生データなので、必ずバックアップし、結果を書き出したあとも保管してください。自動バックアップについてはHVSが助言できます。

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.BONDファイルには時刻付きのすべての位置と設定が入っているので、.hvsファイルが壊れたり誤って解析されたりしても、HVSはそこから補正した.hvsファイルを作り直せます。だからBONDファイルがいちばん大切なのです。

関連: VR試行のデータはどこに保存され、なぜ新しい試行が見えないのですか?

VR水迷路や目標探しの試行はどう解析しますか?

VRの試行は、水迷路とまったく同じように'Morris Water Maze' > 'ANALYZE'で解析します。1)試行をダブルクリックすると図が出て、'OK'でまとめが出ます。'Full Analysis'ではすべてが表示されます。2)一括解析では、試行を選択し、SUMファイルに名前を付けて'Analyze Batch or Series'をクリックします。3)'Export Results / Setup Custom' > SUMを選択 > '2. Define' > 変数を選ぶ > 'Save' > '3. Make Custom Results File'。4)CSTをExcelで開きます。

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'Morris Water Maze'、次に'ANALYZE'をクリックします(ほかのボタンは無視)。試行をダブルクリックすると図が出て、'OK'でまとめが出ます。'Full Analysis'ではすべての指標が表示され保存されます。'Advanced'では解析を追加したり、カウンターの大きさなどの値を変えたりでき、別の値で繰り返すと効果が見えてくることがあります。一括解析では、試行を選択し、'Name your Summary (SUM) file'に名前を入力してEnterを押すか、'Analyze Batch or Series'をクリックします。次に'Export Results / Setup Custom'をクリックし、SUMを選択して'2. Define'をクリック、変数を選び(右側へ移ります)、'Save'、そして'3. Make Custom Results File'を押します。CSTファイルはカンマ区切りで(.csvとして保存するかExcelに取り込みます)、…\Data\Morris Water Maze\CSTにあります。

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VRの解析では、その試行で使ったプラットフォームの位置だけが表示されます(追加の位置はHVSに依頼するか、location_of_interestを使ってください)。補正した.hvsファイルは、いつでも.BONDの生データから作り直せます。

関連: 解析画面は何のためのものですか? · 書き出す結果はどう選べばよいですか('Export Results / Setup Custom')?

方法の項では、HVS 6D VRについてどんな技術的な詳細を報告すべきですか?

バージョン、vrScriptの設定、解析の定義を報告してください。1)解析のバージョンはHVS Imageのメインメニューの右側にあります。2)HVS 6D VRは時刻付きの位置を記録し、HVS Imageは100 msごとに1つの位置へ平滑化します。3)活動速度は不活動のしきい値(既定0.05 m/s)以上の区間だけを使います。4)vrScriptのリファレンスDOI 10.5281/zenodo.22303968を引用してください。

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HVS 6D VRは時刻付きの位置を可変のレート(ある例では毎秒約68回)で記録し、HVS Imageはそれを100 msごとに1つの位置(10 Hz)へ平滑化して.hvsに保存し、すべての指標に使います。活動速度 = 連続する平滑化位置間のユークリッド距離/経過時間で、不活動のしきい値(既定0.05 m/s、調整可、ちょうど0.05は活動とみなす)以上の区間だけを使います。開始位置と向きはvrScriptで試行ごとに定義され、.BONDのヘッダーに記録されます。HVS 6D VRは実験者による介助を記録しません(スクリプトによる音声は可能)。vrScriptファイルとBONDのヘッダーが最良の設定記録です。

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HVSのvrScript技術リファレンス(DOI 10.5281/zenodo.22303968)と不活動の資料(DOI 10.5281/zenodo.21797205)を引用してください。補正ギャラガー全体近接度(CGPROXmt):理論的な時間 t = d0 / v_active。floor(t × f)個のサンプルを除外し、残りの距離の平均をとります。活動速度やサンプルがなければN/Aで、タイムスライスは試行開始を基準にします。

関連: 遊泳速度が速すぎるようです。速度はどう計算され、何を確認すべきですか? · どのVRファイルを保管し、バックアップすべきですか?

VRの座標は象限(NE、SE、SW、NW)にどう対応しますか?

象限の境界はプールの中心を通ります:Quad1 = NE、Quad2 = SE、Quad3 = SW、Quad4 = NW。1)NEは正のxと正のz。2)SEは+x、-z、SWは-x、-z、NWは-x、+z。

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VRの解析では横軸がz = 0、縦軸がx = 0で、どちらも中心を通ります。NE = x+ z+、SE = x+ z-、SW = x- z-、NW = x- z+。Quad1 NE、Quad2 SE、Quad3 SW、Quad4 NWで、ビデオトラッキングの順序(NEから始まり時計回り)と同じです。

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象限の指標は、目標が象限の中心にあるときだけ意味があります。そうでなければ、近接遭遇とギャラガー近接度を使ってください。

関連: 標的象限での滞在時間の割合は、どんなときによい指標ですか? · 象限への進入とその順序から何がわかりますか?

独自の指標を持つ関連するVR課題として、三角形完成(帰巣)課題があります。

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